خلاصه داستان گاوخونی داستان جوانی است كه از اصفهان (زادگاهش) به تهران پناه آورده تا خاطرات دوران كودكی و نوجوانی و مرگ مادر و پدرش را فراموش كند. راوی داستان همین جوان است و خواب‌هایی را روایت می‌كند كه چند ماه پس از مرگ پدرش شروع شده و در آنها پدر سعی می‌كند او را با خود به باتلاق گاوخونی ببرد. این خواب‌ها و خاطرات پدر و یاد و وابستگی مرموز پدر به رودخانه شهر (زاینده‌رود)، راوی را كلافه و پریشان كرده و موجب جدایی او از همسرش (دختر عمه سابقش) و فرار از اصفهان شده است ، اما پدر در تهران هم به سراغ راوی می‌آید و ...